کان زواج فاطمة(س) مع الإمام علي(ع) أمر من الله، حیث امر رسوله(ص) بأن یزوج فاطمة من علي(ع). ذکر هذا الحدیث عن أمیر المؤمنین(ع) فی مصادر مختلفة. وأیضا روى الامام الرضا(ع) هذا الخبر عن لسان أمیر المؤمنین قائلا:
لقد صممت بالزوج، فلم استطع أن أذکر ذلک لرسول الله(ص)، و کان ذلک یشغل فکری حتى دخلت على رسول الله(ص)، فقال لی: یا علي هل لک فی التزویج؟ قلت: رسول الله أعلم، فظننت أنه یرید أن یزوجنی ببعض نساء قریش، وإنی لخائف علی فوت فاطمة، فما شعرت بشیء، إذ دعاني رسول الله(ص)، فأتیته فی بیت أم سلمة، فلما نظر الی بوجه متلألئ بالفرح، تبسم و قال لی: یاعلی أبشر، فان الله تبارک وتعالى قد کفاني ما کان أهمني فی أمر تزویجک، قلت: ما الأمر؟! قال: أتاني جبرائیل ومعه من سنبل الجنة فاخذته وشممته وقلت: یا جبرائیل ما سبب هذا السنبل؟ فقال: إن الله تبارک وتعالى أمر سکان الجنان أن یزینوا الجنة، وأمر حور العین بقراءة سورة طه، والشوری وکل سورة تبدا ب«سطم»، وأمر منادیا، أن ینادي: ألا یا ملائکتي! وسکان جنتي! اشهدوا أنی قد زوجت فاطمة بنت محمد(ص) من علي بن أبي طالب رضى منی بعضهما لبعض، ثم أمر الله تبارک وتعالى ملکا اسمه راحیل بان یقرأ خطبتهما، ثم أمر منادیا، أن ینادی: ألا یا ملائكتي! وسکان جنتي بارکوا على علي بن أبی طالب(ع) حبیب محمد(ص) وفاطمة بنت محمد(ص) فاني قد بارکت فأبشر يا علي، فأنی قد زوجتک إبنتي فاطمة على ما زوجک الرحمن، وقد رضیت لها بما رضي الله لها، وهنا رفع علي یده بالدعاء وقال: رب أوزعنی أن اشکر نعمتک التی أنعمت علي فقال رسول الله: آمین.